Skuad Pemain Persipura Jayapura dikenal sebagai klub bola yang melahirkan pemain lokal yang berkualitas internasional seperti Boaz Solossa, Ardiles Rumbiak, Chris Yarangga, Christian Warobay, Erol Iba, Gerald Pangkali, Jack Komboy, Yohanes Auri, Stevie Bonsapia, Titus Bonai, Jendri Pitoy, Eduard Ivakdalam, Ricardo Salampessy dan Patrich Wanggai. Dengan banyaknya melahirkan pemain lokal yang hebat, Persipura Jayapura sudah banyak meraih prestasi dimana prestasi tertingginya hingga kini adalah menjadi empat kali juara Liga Indonesia dari tahun 2005 hingga 2013. Di era Perserikatan, prestasi Persipura adalah runner-up Divisi Utama (1980) dan dua kali juara Divisi I (1979 dan 1993).
Skuad pemain Persipura Jayapura
| No | Position | Player | Nation |
| 1 | Goalkeeper | Yoo Jae-Hoon | Korea Selatan |
| 27 | Goalkeeper | Dede Sulaiman | Indonesia |
| 30 | Goalkeeper | Bernandus Kasse | Indonesia |
| 2 | Defender | Roni Beroperay | Indonesia |
| 4 | Defender | Ricardo Salampessy | Indonesia |
| 5 | Defender | Izaac Wanggai | Indonesia |
| 14 | Defender | Ruben Sanadi | Indonesia |
| 21 | Defender | Yustinus Pae | Indonesia |
| 28 | Defender | Andri Ibo | Indonesia |
| 31 | Defender | Dominggus Fakdawer | Indonesia |
| 44 | Defender | Yohanis Tjoe | Indonesia |
| 49 | Defender | Jaelani Arey | Indonesia |
| 68 | Defender | Eldjo Iba | Indonesia |
| 8 | Midfielder | Victor Pae | Indonesia |
| 10 | Midfielder | Robertino Pugliara | Argentina |
| 11 | Midfielder | Imanuel Wanggai | Indonesia |
| 12 | Midfielder | Nelson Alom | Indonesia |
| 13 | Midfielder | Ian Louis Kabes | Indonesia |
| 19 | Midfielder | Agus Kogoya | Indonesia |
| 23 | Midfielder | Prisca Womsiwor | Indonesia |
| 29 | Midfielder | Nerius Alom | Indonesia |
| 32 | Midfielder | Muhammad Tahir | Indonesia |
| 9 | Forward | Edward Wilson | Indonesia |
| 17 | Forward | Yohanes Pahabol | Indonesia |
| 18 | Forward | Ricky Kayame | Indonesia |
| 24 | Forward | Marinus Wanewar | Indonesia |
| 33 | Forward | Lukas Mandowen | Indonesia |
| 46 | Forward | Osvaldo Haay | Indonesia |
| 86 | Forward | Boaz Solossa | Indonesia |
| 98 | Forward | Israel Wamiau | Indonesia |
Profil dan Detail Tim Persipura Jayapura
- Nama lengkap : Persatuan Sepak bola Indonesia Jayapura
- Julukan : Mutiara Hitam
- Didirikan : 1963
- Stadion : Mandala, Jayapura, Indonesia
- Kapasitas : 40.000
- Ketua Umum : Benhur Tommy Mano
- Sekretaris : Thamrin Sagala
- Bendahara : Saleh Raharusun
- Manajer : Rudi Maswi
- Pelatih : Angel Alfredo Vera
- Asisten Pelatih : Toni Ho
- Dokter Tim : Agustinus Heatubun
- Liga : Indonesia Soccer Championship